专项附加扣除不是在工资里扣。专项附加扣除是指纳税人在缴纳个人所得税时，在其应纳税所得额中扣除子女教育、继续教育等专项扣除，再适用相应的个税税率。
《个人所得税法》
第十一条
居民个人取得综合所得，按年计算个人所得税；
有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次预扣预缴税款；
需要办理汇算清缴的，应当在取得所得的次年三月一日至六月三十日内办理汇算清缴。预扣预缴办法由国务院税务主管部门制定。居民个人向扣缴义务人提供专项附加扣除信息的，扣缴义务人按月预扣预缴税款时应当按照规定予以扣除，不得拒绝。非居民个人取得工资、薪金所得，劳务报酬所得，稿酬所得和特许权使用费所得，有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次代扣代缴税款，不办理汇算清缴。
《个人所得税法》
第十一条
居民个人取得综合所得，按年计算个人所得税；
有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次预扣预缴税款；
需要办理汇算清缴的，应当在取得所得的次年三月一日至六月三十日内办理汇算清缴。预扣预缴办法由国务院税务主管部门制定。居民个人向扣缴义务人提供专项附加扣除信息的，扣缴义务人按月预扣预缴税款时应当按照规定予以扣除，不得拒绝。非居民个人取得工资、薪金所得，劳务报酬所得，稿酬所得和特许权使用费所得，有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次代扣代缴税款，不办理汇算清缴。