自建房确认权属流程如下：
1、申请。农村房屋所有人提出向政府部门提出确权申请；
2、受理。政府部门受理村民的申请，并对房屋进行调查，看是否符合规定建房的相关规定，再安排人员现场去勘测，宅基地的面积有没有超出规定的面积，是否存在争议；
3、审核。对调查、勘测没有问题的农村房屋进行审核通过；
4、公告。在公告栏进行公布昭告，看其他村民是否有异议，没异议的则符合要求；
5、登记。将需要确权的农村房屋进行登记在册；
6、发证。农村带着上述的证明材料去当地的房产局办理农村房屋登记手续，并缴纳相关费用，下发农村房屋确权证书。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》
第二百三十四条 【物权确认请求权】因物权的归属、内容发生争议的，利害关系人可以请求确认权利。
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