在不同组织山羊表达特征和成肌细胞中表达水平。【方法】本研究采用qRT-PCR方法检测miRNA簇基因在山羊组织以及C2C12
细胞不同生肌时间点的动态表达模式。【结果】miRNA簇基因(miR-665, miR-127-5p, miR-136-3p, miR-136-5p, miR432-5p, miR- 432-3p和miR433)在不同波尔山羊组织中均广泛表达。miR-127-5p,miR-136-3p, miR432-5p,miR432-3p和miR433在山羊肌肉
中高表达,miR-136-5p和miR«65在肌肉表达量低。miR-136-3p表达量随肌细胞增殖和分化逐浙升高;miR-127-5p,miR432-3p,
miR432-5p,miR433和miR-136-5p表达量呈现先升高后降低的趋势;miR-665在随C2C12细胞增殖和分化表达逐浙降低。【结
论】本研究结果为进一步阐明miRNA簇基因调控骨骼肌的生长发育的调控功能奠定了理论基础。关键词:miRNA簇;体组织;C2C12细胞;表达分析;中图分类号:S827
文献标识码:AExpression Analysis of miRNA Cluster Genes in Goats Tissues and Different Periods of C2C12 CellsLI Jie, REN Hang-xing, WANG Gao-fu, JIANG Jing, SUN Xiao-yan, ZHOU Peng*(Herbivorous Livestock Institute, Chongqing Academy of Animal Sciences, Chongqing Rongchang 402460, China)Abstract: [ Objective ] The present paper aimed to clarify miRNA cluster genes ( miR-665, miR-127-5p, miR-136-3p, miR-136-5p, miR-432- 5p,miR-432-3p and miR-433) in expression characteristics of goats tissues and dynamical expression of proliferating and differentiating C2C12 Cells. [ Method] qRT-PCR was used to detect the expression patterns of miRNA cluster genes in different tissues of Boer goats and different growth time points at myoblast proliferating and differentiating. [ Result] miRNA cluster genes ( miR-665 , miR-127-5p, miR-136- 3p,miR-136-5p,miR-432-5p,miR-432-3p and miR-433) were widely expressed in different tissues of Boer goats, miR-127-5p,miR-136- 3p,miR-432-5p,miR-432-3p and miR-433 were highly expressed in muscle of Boer goats, miR-432-5p and miR-665 were lowly expressed in
muscle. Besides, miR-136-3p were expressed increasingly during proliferation and differentiation of C2C12 cells, the expression level of miR-127-5p, miR-432-3p, miR-432-5p, miR-433 and miR-136-5p increased first and then decreased, miR-665 was expressed decreasingly
in C2C12 Cells. [ Conclusion] The results of this study provide a theoretical basis for further clarifying miRNA cluster genes in regulation of
skeletal muscle growth and development.Key words:miRNA cluster; Tissues; C2C12 cell; Expression analysis【研究意义】骨骼肌的形成是一个高度复杂且 这些复杂过程的顺利进行不仅受许多编码蛋白的因
有序的生物学过程,主要包括成肌决定,成肌细胞增 殖,细胞周期的退出,肌肉特异性基因的表达,肌细
子调节,如成肌调节因子家族(MRFs),肌细胞增强
子因子2家族(MEF2)和对框基因(Pax)家族,而且 还受到非编码RNAs的调控,如microRNAs ( miR- NAs)。【前人研究进展]miRNAs是一类新发现的
胞融合形成多核肌管,多核肌管再经过一系列发育 变化,最后分化成为具有功能的成熟肌纤维3]。收稿日期:2019 - 02-15基金项目:重庆市农发资金项目(15404)作者简介:李 杰(1989 -),男,助理研究员,主要从事山羊遗 传育种研究,E-mail:cqhyljie@ 163. com, *为通讯作者:周 鹏, 男,研究员,研究方向为动物遗传育种,E-mail :zp2006@ 163.como
非编码小分子RNA,长约22nt(核昔酸),通过与靶
mRNA特异性的碱基互补配对,引起靶mRNA降
解、稳定性下降或者抑制其翻译,从而调控基因的转
录后表达水平⑶。研究表明,miRNAs参与了增殖、
分化、凋亡、发育从细胞到个体的整个生命过程及肿
176蜀鬲农北爭叔.33卷瘤发生过程⑷。miR-665 , miR-127-3p/5p, miR-136-
3p/5p, miR432-3p/5p 和 miR433 同位于山羊 21
号染色体,形成一个特殊的miRNA簇。笔者前期用
高通量测序(RNA-Seq)法对Texel羊(MSTN突变
型)与乌珠穆沁羊(MSTN野生型)胎儿骨骼肌miR-
NA进行转录组测序,发现miR-127-3p与miR-1/ 206/133在两品种羊骨骼肌中在骨骼肌高表达miR- NAs,且miR-127-3p在2个品种羊骨骼肌中差异表
达⑸。Li等的研究发现miR-127-3p在波尔山羊肌 肉组织表达量高于巫山黑山羊,同时miR-127-3p在
增殖的C2C12细胞的表达量高于分化时期的细
胞国。【本研究切入点】而位于同一个miRNA簇的
miR-665, miR-127 -5p, miR-136-3p, miR-136-5p, miR- 432-5p,miR^32-3p和miR433在山羊组织和细胞
的表达模式目前尚未见相关的文献报道。本研究首 先以波尔山羊体组织为试验材料,检测在不同组织
中 miRNA 簇基因(miR-665 , miR-127-5p, miR-136- 3p, miR-136-5p, miR432-5p, miR432-3p 和 miR-
433)的表达情况,接着分别检测C2C12细胞增殖与 分化不同生肌时间点第0、2、4、6、8天中miRNA簇
基因动态表达模式。【拟解决的关键问题】为阐明
miRNA簇基因在骨骼肌的生长发育的调控作用提
供一定的理论依据O1材料与方法1.1试验材料在巫山县振兴农牧科技开发有限公司随机选取 3只成年的波尔山羊,屠宰后立即采集样品,DEPC
水清洗后装管置于液氮中,用于肌肉组织RNA提 取。C2C12细胞为本实验室保存。TRIzol Reagent
购自 invitrogen 公司(美国);miScript II RT Kit 与
miScript SYBR Green PCR Kit 均购自 QIAGEN 公司 (德国);DMEM培养基购自gibco公司(北京);胎牛
血清(FBS)、马血清(HS)和青链霉素购自HyClone
公司(新西兰);其他化学试剂均为国产分析纯。12细胞培养C2C12细胞生长培养基(GM)为含10 %胎牛
血清的DMEM培养基。当细胞融合度达到85 %左
右时更换为分化培养基(DM)为含2 %马血清的 DMEM培养基,GE和DM中均需均加入1 %的双
抗,隔天更换一次培养基。分别在增殖和分化阶段
的0、2、4、6、8 d收集细胞,用于提取细胞的miRNA。 13 miRNA的提取与反转录组织提前用液氮充分研磨,细胞吸弃培养基后,
用PBS清洗2 ~ 3次,加入TRIzol提取RNA。组织 和细胞的总 RNA 按照 TRIzol Reagent (Invitrogen,美表1 miRNA簇基因引物序列信息Table 1 Primer information of miRNA cluster genes基因引物序列(5—3,)GenePrimers sequences (5,・3 ')miR-665ACCAGTAGGCCGAGGCCmiR-127-5pAAGCTCAGAGGGCTCTGATTmiR-136-3pAGCATCATCGTCTCAAATGAGTCTmiR-136-5pACGACTCCATITGTnTGATGATGGmiR-432-5pTCTTGGAGTAGGTCATTGGGTGmiR/32-3pACTGGATGGCTCCTCCATmiR433ATCATGATGGGCTCCTCGU6AGAGAAGATTAGCATGGCCCCTG国)提取试剂盒的操作步骤提取。RNA完整性用1
%琼脂糖凝胶电泳检测,浓度和纯度采用NanoDrop
2000超微量分光光度计(Thermo,美国)检测。经
检测完整性良好的RNA用miScript II RT Kit(QIA-
GEN,德国)反转录合成cDNA。其中反应体系为20
山,包含3(±1(400 ng/|jLl) ,5 xmiScript HiSpec Buffer
4 |il, 10 x miScript Nucleics Mix 2 |jl1, miScript Re
verse Transcriptase Mix 2 |±1, RNase ddH2O 9 心。合
成产物-20咒保存备用(表1)。1.4 RT-qPCR按照 miScript SYBR Green PCR Kit (QIAGEN,
德国)试剂盒说明书,对组织与细胞进行荧光定量
检测分析,U6作为内参基因。反应体系(20讪):模 板 cDNA 1 |jl1,2 x QuantiTect SYBR Green PCR Master Mix 10 pul, 10 X miScript Universal Primer 和引物 各1心,RNase ddH2O 7 jxlo反应程序:95 °C预变
性15 min,94咒 变性15 s,55 °C退火30 s,70咒延 伸30 s,共40个循环。每个样品重复3次,所有反 应在 7900HT Fast Real-Time PCR System ( Applied
Biosystems,美国)中进行。15数据分析RT-qPCR中miRNA相对表达量用2 \"人仔法计
算,结果以平均值土标准误(mean 土 SE)表示。2结果与分析2.1 miRNA簇基因在山羊染色体的位置分布由图1可知,miRNA簇基因分布于山羊21号染色体,miR-665位置较前,而其他miRNA在染色联
|
| |nlH-lM-JpiTpChromosome 21-NC_030828.1图1 miRNA簇基因在山羊染色体的位置Fig. 1 miRNA cluster genes in the position of goat chromosome1期李 杰等:miRNA簇基因在山羊组织和不同时期的C2C12细胞的表达分析177a.4■S .3.2 aO .1 a
miR-665* .2針*
1
.2. .9@.6S oo @
miR-127-5p QAno.e-sxi0o-
肾肌肉—1 6+込te 區
ph1 由ir*Pl ft①
氐43AQT 4.03.L.5
-QAQImiR-136-3pAQTuoissaidxduSSQJdxQQARFPMUOISSQJdxQQAtlEyrls.5O
心肝脾肺肾肌肉曙 miR-432-5p2
l. o.o8 4 0
Rz4ACT l..8l.a.2 .6O
心肝脾肺肾肌肉miR-432-3p怕
針*監
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miR-136-5pJ50Io.【 増
U0aidXQQAfr計«
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WMSSQJdx-J3rL肝
miR-433■E■aEIQH脾 肺 肾 肌 肉
心肝脾肺肾肌肉00*新
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图2 miRNA簇基因在波尔山羊体组织的相对表达量Fig. 2 Relative expression of miRNA cluster genes in Boer goats tissues体的位置相对集中,依次为miR433、miR-127-5p、 miR-432-3p/5p,最后是 miR-136-3p/5po miR-433
与miR-127-5p所处的位置有部分重叠基因位点。 通过 BLAST (http://www. ncbi. nlm. nih. gov/)比
较分析miRNA簇基因成熟序列,发现其在哺乳动物
中有较高的保守性。2.2 miRNA簇基因在山羊体组织的表达分析采用qRT-PCR方法检测波尔山羊的心、肝、脾、
肺、肾和背最长肌组织中miRNA簇基因(miR-665,
miR-127-5p, miR-136-3p, miR-136-5p, miR~432-5p,
miR-432-3p和miR-433 )的表达量。由图2可知,
miRNA 簇基因(miR-665, miR-127-5p, miR-136-3p,
miR-136-5p, miR-432-5p, miR-432-3 p 和 miR-433)在
山羊不同组织中均广泛表达。miR-127-5p, miR-
136-3p, miR~432-5p,miR432-3p 和 miR-433 在肌肉 中高表达,miR-136-5p和miR-665在肌肉表达量低。2.3 miRNA簇基因在C2C12细胞不同生肌时间点
的动态表达分析培养C2C12成肌细胞,分别收集增殖和分化不
同阶段的细胞样品,采用qRT-PCR分别检测在不同
生肌时间点细胞中miRNA簇基因(miR-665 , miR-
127-5p, miR-136-3p, miR-136-5p, miR-432-5p, miR- 432-3p和miR433)的表达模式。由图3可知,miR-
AQTuoissaidxd QAHB-SX:.25.50.75O
心'肝■脾’肺肾’肌肉fl R136-3p表达量随肌细胞增殖和分化逐渐增加,在培 养的第8天中表达最高。miR-127-5p,miR432-3p,
miR432-5p,miR433 和 miR-136-5p 表达量呈现先 升高后降低的趋势,miR-127-5p和miR433在增殖
与分化的第6天的表达最高;miR432-3p在增殖的 第2天与分化的第6天表达最高;miR432-5p在增
殖的第4天与分化的第8天表达最高;miR-136-5p 在增殖与分化的第2天表达最高。miR-665随
C2C12细胞增殖和分化表达逐渐降低。3讨论通常miRNA与其宿主基因转录表达的同时会
受到多种因子的调控,miRNA却往往表现出一定的 组织和时空的特异性。miR-l/miR-206 /miR-133仅
在肌肉组织中特异表达,而miR-127-3p在动物的多
个组织广泛表达,且在肌肉、皮肤和脾脏中表达较
高[6_7]o本研究采用qRT-PCR法对波尔山羊组织
中miRNA簇基因的表达量进行检测,发现miRNA
簇基因(miR-665 , miR-127-5p,miR-136-3p, miR-136- 5p, miR-432-5p, miR-432-3p 和 miR-433 )在山羊不
同组织中均广泛表达。miR-127-5p, miR-136-3p,
miR432・5p,miR~432-3p 和 miR433 在肌肉中高表 达,miR-136-5p和miR-665在肌肉表达量低。揭示17833卷0.60miR-6651A.6 211
.84
miR-127-5p計.2«
W-0.45JWCA
0.15-J3BICH0
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4
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0
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6..O4..5.O 3.L.5 O-s
IQAEuoSQJdxQQABSQHT miRNAs的组织表达特征,确定了 miRNA簇基因 与山羊肌肉表型的关系。骨骼肌的生长发育主要表 现为肌细胞数量的增加和体积的增大,这两方面的
顺利进行依赖于成肌细胞的增殖和分化国。miR
NAs 在转录后水平调控基因表达,在成肌细胞增殖 和分化过程中发挥着重要的作用⑼。笔者近期研 究发现miR-127-3p表达量随C2C12肌细胞分化逐
渐增高,暗示miR-127-3p参与骨骼肌细胞分化的调
控国。体外培养C2C12成肌细胞,采用qRT-PCR
法分别检测在C2C12增殖和分化不同生肌时间点
细胞中miRNA簇基因的表达水平。研究发现miR- 136-3p表达量随肌细胞增殖和分化逐渐增加。 miR-127-5p, miR432-3p, miR432-5p, miR433 和
miR-136-5p表达量呈现先升高后降低,miR-665在
C2C12增殖和分化的过程中表达逐渐降低。该研究
首次确定miRNA簇基因在山羊体组织的表达水平,
并分析C2C12细胞增殖和分化阶段的动态表达模
式。本研究发现miR-127-5p在山羊组织中广泛表
达,其在增殖的C2C12细胞的表达量高于分化时 期,这与笔者等岡的研究确定miR-127-3p在山羊体 组织广泛表达,其在增殖的肌细胞的表达量高于分 化时期的结果是一致。但文献报道miR-127在桐城
Uss9jdxe■S cn4 6 80.40.3时间(d)时间(d)miR-432-5p uo-scfiQJdxQ
时间(d)129 6 3
IQAEmiR-136-5pmiR-432-3pAQTUOIS0.2 J
慎故«餐
66 4 2 0
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图3 miRNA簇基因在C2C12细胞增殖和分化的不同阶段的相对表达量Fig. 3Relative expression of miRNA cluster genes during C2C12 myoblast proliferation and differentiation猪组织的表达高于长白猪,而且miR-127主要在胚
胎发育的中后期保持较高的表达水平,在发育的早
期和出生后表达相对低⑷o这显然不同于miR-127
在猪上的研究报道。分析原因可能是miR-127基因 在经pre-miR-127剪辑后生成两种形式的成熟的
miRNA:miR-127-3p 和 miR-127-5p,而该研究仅是
检测miR-127-5p的表达水平。miR433在肌肉组织
和C2C12细胞高表达,其与miR-127来自于同一个
重叠基因位点,暗示miR433可能也在成肌增殖与
分化过程中发挥着重要的作用。但目前研究多集中
报道miR433抑制乳腺癌增长少],食管癌的增殖与 侵袭Z以及人骨肉瘤细胞凋亡问等医学方面。 miR432基因在经pre-miR432剪辑后生成两种形
式的成熟的 miRNA: miR432-3p 和 miR432-5p。
miR432-3p在肌肉组织高表达,在增殖的C2C12细 胞的表达量高于分化时期,暗示miR432-3p可能参
与骨骼肌肌细胞的生成,与肌肉生长发育密切相关。
这与Ma等问发现miR432在小鼠的组织与细胞的 表达是一致的。但是Ma主要分析了细胞前期中的 miR432的表达,该研究检测miR432-3p增殖与分
化过程中不同时间点的表达。miR432-5p在肌肉
组织和C2C12细胞高表达,需要进一步的深入研究 其在成肌细胞生成过程中的调控功能。miR-136-3p
1期李杰等:miRNA簇基因在山羊组织和不同时期的C2C12细胞的表达分析179
在波尔山羊肌肉组织中高表达,其表达量随着肌细
胞增殖和分化逐渐增加。Lu等[⑷高通量测序 (RNA-Seq)法分析发现在猪骨骼肌miR-136表达量 高。之前利用高通量测序(RNA-Seq)法对胚胎期和 出生的简洲大耳羊的背最长肌miRNA进行转录组
测序,发现miR-136-5p是骨骼肌高表达miRNA[15]。
该研究主要分析成年山羊miR-136-5p的表达水平,
可能是由于miR-136-5p在山羊的早期发育高表达,
而成年后表达量减少。进一步揭示了 miR-136对哺
乳动物骨骼肌的生长发育起重要作用。研究报道
miR-665抑制卵巢癌细胞的增长和迁移①],同时
MiR-665还抑制髓核细胞的增殖和基质降解
miR-665在C2C12细胞增殖和分化的过程中表达逐 渐降低。暗示可能其在C212细胞中是具有相同的
抑制作用。通过体内和体夕卜研究分析miRNA簇基因(miR
-665, miR-127-5p, miR-136-3p, miR-136-5p, miR-432-
5p,miR432・3p和miR433)表达模式,确定在个体
与细胞水平miRNAs的表达水平,系统阐述了 miR-
NA簇基因表现出一定的组织和时空的特异性,揭
示其对肌肉生长发育调控的分子机理,不但对将来
畜禽基因工程育种,也对人类肌肉疾病的发病机理
的研究与治疗提供参考。4结论体内组织检测发现,miRNA簇基因(miR-665,
miR-127-5p, miR-136-3p, miR-136-5p, miR-432-5p,
miR432-3p和miR433)在山羊不同组织中均广泛
表达。miR-127-5p, miR-136-3p, miR-432-5p, miR- 432-3p和miR433在肌肉中高表达,miR-136-5p和
miR-665在肌肉表达量低。体外细胞检测发现,
miR-136-3p表达量随肌细胞增殖和分化逐渐升高; miR-127-5p, miR-432-3p, miR~432-5p, miR-433 和
miR-136-5p表达量呈现先升高后降低的趋势;miR-
665 在随C2C12细胞增殖和分化表达逐渐降低。综
上,推测miRNA簇基因可能参与骨骼肌细胞增殖与
分化的过程。下一步将通过构建过表达、干扰载体,
转染卫星细胞或成肌细胞,系统阐述miRNA簇基因
对骨骼肌生长发育的调控功能。参考文献:[1 ] COMAI G, TAJBAKHSH S. Molecular and Cellular Regulation of
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