step 1.首先打开软件后,开启图档
ImageJ这套软件可以自动帮你你计算细胞数,也可以定量分析DNA电泳或是Western blot条带。
step 1.首先打开软件后,开启图档
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step 2.请先做校正,选择Analyze底下的Calibrate选项,再选择校正的模式,使用Uncalibrate OD,再按ok
按下ok之后会出现校正的图形
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Step 3.在要分析的第一条(first lane)加上一个长型框(工具列第一个选项),再按下Analyze/Gels/select first Lane快速键(Ctr+1),此时框架中会出现一个号码1,之后可以移动框架到第二个lane再选择Analyze/Gels/select second Lane快速键(Ctr+2),当然可以一直加下去,最后按Analyze/Gels/plot Lanes快速键(Ctr +3)。
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Step 4.分析以后会出现图型表示你刚选择的框内的影像强度,此时可以看到有几个比较高的区段,就是我们想定量的band,使用直线工具(工具列第五个选项)先将图形中高点为有band的区域和没有band的区域分开再,使用魔术棒工具(工具列第八个选项)点选要分析的区域。
Step 5.当我们点选分析时,在result的对话视窗会出现分析的数据,依序点选就会出现每个band的值。
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注:当我们选择分析的条带也可以是横向选取,就可以只比较相同大小的DNA的含量,同样也可以应用在western blot或其它类似实验条带的分析上。
使用ImageJ 分析图像中的颗粒数
[NanoUnion.Net] 原创教程,转载请保留此行
1,到本站资料下载-实用小工具栏目下载 ImageJ 并安装。 2,打开ImageJ并打开要分析的图片。请看演示图片。
3,把图像二值话或者设定阈值。选择 Image - Adjust - Threshold...
根据提示设定你需要的阈值。这一步非常重要,关系到结果的正确性。设定阈值的标准就是把是颗粒的地方都突出出来。示例中颗粒都被染成了红色。
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4,菜单 Analyze - Anelyze particles... 自动统计结果。示例图片中有2个1像素的点都被统计出来了。结果非常准确。
使用ImageJ 分析图像中的颗粒数
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1,到本站资料下载-实用小工具栏目下载 ImageJ 并安装。 2,打开ImageJ并打开要分析的图片。请看演示图片。
3,把图像二值话或者设定阈值。选择 Image - Adjust - Threshold...
#1
根据提示设定你需要的阈值。这一步非常重要,关系到结果的正确性。设定阈值的标准就是把是颗粒的地方都突出出来。示例中颗粒都被染成了红色。
4,菜单 Analyze - Anelyze particles... 自动统计结果。示例图片中有2个1像素的点都被统计出来了。结果非常准确。
ImageJ 功能强大,其他功能请自学或者听下回分解!再见~~~ 附件:
particle.JPG (9.26 KB)
adjust.JPG (26.63 KB)
ImageJ 功能强大,其他功能请自学或者听下回分解!再见~~~
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adjust2.JPG (22.57 KB)
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result.JPG (38.38 KB)
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2007/4/6 21:53
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生物医学影像分析软件--ImageJ计算细胞数
www.ggene.cn 2009年04月21日 22时21分52秒 来源:未知 浏览: 522次
相信许多朋友也许也在找一种影像软体,可以自动帮你计算细胞数,比方说常常用使用4'-6-Diamidino-2-phenylindole (DAPI),或是用其它的抗体在做免疫染色(Immunohistochemistry Staining),要如何把影像的资讯数量化呢?最常用的就是计算染色的细胞数。那有没有软体可以自动帮你算细胞数呢?大概在90年中就有人在做这种影像分析,在2000年左右也有不少文章介绍各实验室自己开发的软体,也免费的提供下载。最近由猪排饭同学介绍一套软体ImageJ,是由National Institutes of Health (NIH)所开发免费且跨平台(windows、Mac、Linux都可用)的影像分析软体,试用一下觉得相当好用。请参考以下之教学:
step 1. 下载安装ImageJ软体: http://rsbweb.nih.gov/ij/download.html 或ImageJ下载
http://ggene.cn/html/protocol/ruanjianjiaocheng/2009/0421/284.html
请依据不同作业系统选择适合的版本
step 2. 打开软体,再开启要分析的图片(File->Open)。
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step 3.
设定分析影像的阈值(Image->Adjust->Threshold,或快捷键Ctr+Shift+T)
step 4.调整阈值再按set决定。
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step 5.
选择analyze particle(Analyze->Analyze particle) 并且记得要选择summarize,才会有分析的结果。
step 6.
分析结果,可以看到原图像的视窗会出现电脑判读的数据,summary会显示个数及分析影像的区域大小
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